[Résolu] question sur le comptage de caractères

Sabbou · Le 28/09/2021, à 21:11

bonsoir,
étant une jeune pousse dans le milieu de linux et plus généralement de la programmation, j'aurai aimé dans un contexte biologique compter le nombre de caractère que possède ma séquence.
Le fichier texte se décline sous la forme suivant : Organisme sur la première ligne, séquence sur la deuxième
Je voudrais donc savoir quelle commande m'indiquera le nombre de caractères sur la deuxième ligne, et cela sans se servir du numéro de la ligne.
Je pense après quelque recherche qu'il faudra utiliser la commande wc -m, mais j'ai du mal à faire comprendre que je veux seulement les caractères de la deuxième ligne ....

merci de vos réponses

Dernière modification par Sabbou (Le 29/09/2021, à 16:32)

nany · Le 28/09/2021, à 21:42

Bonjour,

Sabbou a écrit :

Je pense après quelque recherche qu'il faudra utiliser la commande wc -m, mais j'ai du mal à faire comprendre que je veux seulement les caractères de la deuxième ligne ....

wc -m est effectivement la bonne commande. Pour afficher seulement la seconde ligne du fichier, on peut utiliser sed par exemple :

sed -n '2p' fichier | wc -m

Sabbou a écrit :

Je voudrais donc savoir quelle commande m'indiquera le nombre de caractères sur la deuxième ligne, et cela sans se servir du numéro de la ligne.

Alors, si tu ne veux pas te servir du numéro de ligne, on peut utiliser une regex toujours avec sed :

sed '/Organisme/d' fichier | wc -m

Pour plus d’info :

man sed

Watael · Le 28/09/2021, à 21:59

attention. wc -m compte le retour chariot en fin de ligne comme un caractère.

{ read; read; echo ${#REPLY};} < fichier

ou

printf "$(sed '/Organisme/d' fichier)" | wc -m

nany · Le 28/09/2021, à 22:23

Watael a écrit :

attention. wc -m compte le retour chariot en fin de ligne comme un caractère.

Ah oui anéfé, j’avais pas testé.

Du coup la meilleure solution est celle avec read car on ne lit effectivement que la deuxième ligne du fichier même si celui-ci comporte plus de deux lignes (le sed est foireux dans ce cas).

ar barzh paour · Le 29/09/2021, à 09:27

waouh

{ read; read; echo ${#REPLY};} < fichier

+1
je note !

REPLY Set to the line of input read by the read builtin command when no argu‐
ments are supplied.

voir

help read

Dernière modification par ar barzh paour (Le 29/09/2021, à 10:11)

Sabbou · Le 29/09/2021, à 15:19

merci pour vos réponses, cela m'a été judicieusement utile. bien à vous

ar barzh paour · Le 29/09/2021, à 16:29

OK alors transforme le titre de ta discussion
question sur le comptage de caractères
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